L'année suivante les hommes se voient porter des jupes sur les passerelles et la mode s'annonce unisexe et le fameux bustier conique fait son apparition. Un soupçon de provocation s'ajoutera dès lors aux collections.

Le succès grandissant, les commandes se font de plus en plus nombreuses et, de fil-en-aguille, le couturier est amené à dessiner des costumes pour diverses représentations et films, on cite notement "Kika", de Pedro Almodovar, "Le Cinquième Élément" et, en 1990, les tenues du fameux "Blond Ambition Tour" de Madonna, ce pour quoi il est encore à ce jour principalement connu pour. Avec Antoine de Caunes, il a animé l'émission britannique Eurotrash (littéralement « europoubelle »).

Jean-Paul Gaultier a aussi créé, entre autres, des tenues pour Mylène Farmer dans les années 1990 ; il signera les tenues sexy que la chanteuse porte sur le shooting de son album Anamorphosée, dans le clip Je t'aime mélancolie ainsi que la robe semi-transparente du clip L'instant X. Il l'habille à nouveau lors de sa tournée de 2009.
Il a lancé également des parfums à son nom.
En 1995, il a présenté les MTV Europe Music Awards à Paris.
En 2004, Jean-Paul Gaultier devient directeur du prêt-à-porter femme chez Hermès. Hermès International possède 35 %, puis 45 % de la société Jean-Paul Gaultier et des rumeurs circulent en 2008 sur un possible rachat.
En mai 2008, il commente pour France 3 le 53ème Concours Eurovision de la chanson aux côtés de Julien Lepers en direct de Belgrade, en Serbie.
En 2009, Jean-Paul Gaultier habille les candidats de l'émission Nouvelle Star saison 7. Il apparait également dans le clip vidéo Boys and Girls de Martin Solveig .
Le 5 décembre 2009, il est un des membres du jury de l'élection de Miss France 2010. Quelques jours après il habille Miss France 2010, Malika Ménard et pose avec elle dans le magazine Gala.

Ouvertement homosexuel, il est considéré comme un symbole de la culture gay française et internationale.