En 2002, elle réalise, pour TV5 (chaîne internationale de la francophonie), 50 modules, sur le thème de la diversité culturelle, à partir de témoignages d'artistes, de créateurs et de journalistes.

Après Place de la République sur France 2, elle présente D'une rive à l'autre de la Méditerranée en 2003. Elle est présidente du FIPA (Festival International de Programmes Audiovisuels) pour 3 ans.

Entre 2002 et 2005 suivront plusieurs documentaires et moyens métrages :
- Le jardin parfumé, un documentaire sur la sexualité dans le monde arabomusulman.
- Aïcha, Mohamed, Chaïb et les autres, un documentaire qui traite de la problématique des jeunes, issus de l'immigration qui s'engagent dans l'armée de métier
française.
- Le Plafond de verre qui traite de l'apartheid invisible qui frappe les jeunes surdiplômés issus de l'immigration, victimes de discriminations liées à leur origine, à leur nom, ou à leur adresse.
- Les Défricheurs un documentaire qui montre le parcours de ceux qui ont pu bénéficier de cette première chance qui leur ouvre les portes des entreprises.
Le plafond de verre et Les défricheurs ont une sortie nationale en salle de cinéma et resteront plusieurs mois à l'affiche.

A cette occasion, elle initie le jeudi citoyen : chaque jeudi, des personnalités du monde politique, artistique et économique, venaient débattre avec le public sur le thèmes des discriminations des préjugés raciaux hérités du colonialisme. Le Plafond de verre est aujourd'hui utilisé au sein des entreprises (plus de 240, à ce jour) y compris le MEDEF, comme support pour lutter contre les discriminations à l'embauche.

En 2006, elle initie pour le programme européen Equal, Changer de regard une série de trente films courts, qu'elle produit et réalise à l'intention des entreprises et des universités européennes, pour lutter contre les discriminations à l'embauche.

Son documentaire Aïcha, Mohamed, Chaïb engagés pour la France , sur l'intégration dans l'armée, est diffusé sur en octobre de la même année, elle reçoit à Florence le prix Il Sigillo della Pace pour l'ensemble de son travail.

Au printemps 2006, Yamina Benguigui, Philippe Dupuis Mendel, Marc Ladreit De Lacharrière (fondateur de Fimalac, Fitch, la revue des deux mondes, etc) créent la société de production ELEMIAH.

Il s'agit avec cette société de production de " favoriser la représentation des minorités à la télévision et au cinéma". Elle emploiera des personnes issues de l'immigration et produira des fictions mettant en scène des héros de toutes les origines. Elle réalise un documentaire pour Canal+, Le 9/3, mémoire d'un territoire , et Aïcha , une série de téléfilms sur le quotidien d'une jeune fille de banlieue, pour France 2 avec Sofia Essaidi dans le rôle principal.

Le documentaire 9 /3, mémoires d'un territoire diffusé le 29 septembre 2008 a été acclamé par la critique et a reçu de nombreux pris. Yamina Benguigui y retrace l'histoire du département de la Seine Saint-Denis, le 93, de 1850 à nos jours. Selon ce documentaire, une des raisons des émeutes de banlieue est liée à la discrimination territoriale.

Grande amie d' Isabelle Adjani , Yamina Benguigui est élue conseillère municipale à Paris (20ème) sur la liste PS de Bertrand Delanoë . Adjointe au maire de Paris, elle est en charge des droits de l'homme et de la lutte contre les discriminations.